人类MID1的RBCC/TRIM B-box1域的解结构:带RING的B-box。

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Massiah MA, Simmons BN, Short KM, Cox TC

人类MID1的RBCC/TRIM B-box1域的解结构:带RING的B-box。

中华分子生物学杂志。2006年4月28日;358(2):532-45。Epub 2006年2月20日。

PubMed ID

16529770 (查看PubMed

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摘要

B-box结构域是RBCC (RING, B-box, coil -coil)或TRIM蛋白的一个决定性特征，其中许多是E3泛素连接酶。然而，人们对b盒的生物学功能知之甚少。在一些RBCC/TRIM蛋白中，只有一个B-box (type 2)结构域，而另一些蛋白在其RING结构域附近同时有1型和2型B-box结构域。这两种类型的b -box除了存在半胱氨酸和组氨酸残基外，几乎没有序列相似性:大多数B-box1结构域有8个残基，B-box2结构域有7个残基。我们在这里报告了基于670核Overhauser效应(NOE)导出的距离约束、12个氢键和44个二面角的第一个B-box1结构域(来自人类RBCC蛋白MID1)的高分辨率解结构。该结构域由一个三转的α -螺旋、两条短β -链和三个β -链组成，包括Val117到Pro164, Pro164结合了两个锌原子。一个锌原子与半胱氨酸残基119、122、142、145配位，另一个锌原子与半胱氨酸残基134、137和组氨酸150、159配位。这种拓扑结构明显不同于报告的唯一其他b盒结构;Xenopus XNF7的2型B-box，它结合一个锌原子。值得注意的是，B-box1结构非常类似于E3和E4泛素酶的RING、ZZ和U-box结构域的褶皱，这增加了B-box1结构域本身具有E3活性或增强RING型E3连接酶活性(即赋予E4酶活性)的可能性。 The structure of the MID1 B-box1 also reveals two potential protein interaction surfaces. One of these is likely to provide the binding interface for Alpha 4 that is required for the localized turnover of the catalytic subunit of PP2A, the major Ser/Thr phosphatase.

引用本文的药库数据

药物靶点

药物	目标	种类	生物	药理作用	行动
锌	DNA-3-methyladenine糖基化酶	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节
乙酸锌	DNA-3-methyladenine糖基化酶	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节
氯化锌	DNA-3-methyladenine糖基化酶	蛋白质	人类	未知的	代数余子式	细节
硫酸锌，形式不明	DNA-3-methyladenine糖基化酶	蛋白质	人类	未知的	代数余子式	细节