蛋白质n端化学选择性标记的蛋白酶切割位点的全局分析。

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徐刚，申世峰，Jaffrey SR

蛋白质n端化学选择性标记的蛋白酶切割位点的全局分析。

中国科学院学报。2009年11月17日;106(46):19310-5。doi: 10.1073 / pnas.0908958106。Epub 2009 11月5日。

PubMed ID

19892738 (PubMed视图

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摘要

蛋白质水解在多种生物过程中起着重要作用，并调节蛋白质的活性、定位和细胞内水平。将信号通路和生理过程与特定的蛋白水解处理事件联系起来是信号转导研究中的一个主要挑战。必威国际app在这里，我们描述了N-CLAP(通过化学标记蛋白质的α -胺的n -末端组学)，一种用于分析蛋白质n -末端和识别细胞信号传递过程中蛋白质切割位点的一般方法。在N- clap中，简单且容易获得的试剂被用于选择性亲和标记α -胺，该α -胺表征了蛋白N端赖氨酸残基上含量更高的ε -胺。通过识别相应的N-CLAP肽，推导出蛋白质的裂解位点，这些肽来自蛋白质的n端，包括蛋白裂解新形成的多肽产物的n端。通过对278个N-CLAP肽的选择性亲和纯化和串联质谱分析，我们鉴定了与蛋氨酸氨基肽酶和信号肽肽酶相关的蛋白水解裂解事件，以及顺铂诱导凋亡后蛋白水解裂解的蛋白质。在凋亡信号传导过程中诱导的许多蛋白裂解位点与caspase依赖性裂解一致。这些数据证明了N-CLAP用于细胞信号传导过程中产生的蛋白质切割位点的蛋白质组学分析。

引用本文的药物库数据

多肽

名字	UniProt ID
NADH脱氢酶[泛醌]铁硫蛋白3，线粒体	O75489	细节
NADH脱氢酶[泛醌]1 β亚复合体亚基2，线粒体	O95178	细节
酰基载体蛋白，线粒体	O14561	细节
天冬酰胺-tRNA连接酶，细胞质	O43776	细节
atp依赖性Clp蛋白酶的蛋白水解亚基，线粒体	Q16740	细节
60S核糖体蛋白l26样1	Q9UNX3	细节
ATP合酶亚单位，线粒体	P25705	细节
ATP合酶亚单位，线粒体	P06576	细节
细胞色素c氧化酶亚基6C	P09669	细节
1, 2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene加双氧酶	Q9BV57	细节
ATP合酶亚基e，线粒体	P56385	细节