喷他脒通过非特异性疏水相互作用与tRNA结合并抑制氨基酰化和翻译。

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孙涛，张勇

喷他脒通过非特异性疏水相互作用与tRNA结合并抑制氨基酰化和翻译。

核酸研究，2008年3月;36(5):1654-64。doi: 10.1093 / nar / gkm1180。Epub 2008年2月7日。

PubMed ID

18263620 (PubMed视图

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摘要

喷他脒对酿酒酵母线粒体翻译的选择性和有效抑制表明这种药物具有新的抗菌作用。电泳迁移率变化试验、T1核糖核酸酶足迹、羟基自由基足迹和等温滴定量热法共同证明喷他脒非特异性结合于tRNA上的两类不同位点。这种结合是由有利的熵变驱动的，表明有较大的疏水相互作用，这表明喷他脒的芳香环插入到tRNA螺旋的堆叠碱基对中。喷他脒的结合破坏了tRNA的二级结构，并掩盖了三级结构中的反密码子环。一致地，我们发现喷他脒特异性地抑制tRNA的氨基酰化，但不抑制同源氨基酸的腺苷化。喷脒在体外抑制蛋白质翻译，其EC(50)相当于与tRNA结合并抑制tRNA氨基酰化的EC(50)，但大大高于在体内抑制翻译的EC(50)，支持了现有的观点，即喷脒的抗菌活性主要是由于其由病原体而不是宿主细胞选择性积累。因此，通过熵驱动的非特异性结合阻断tRNA氨基酰化是喷他脒抑制蛋白质翻译的重要机制，为抗菌药物的开发提供了新的思路。

引用本文的药物库数据

药物靶点

药物	目标	种类	生物	药理作用	行动
喷他脒	tRNA(胞嘧啶(38)- c(5))甲基转移酶	蛋白质	人类	未知的	其他	细节