通过液相色谱质谱筛查N-glycosylated蛋白质。

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Bunkenborg J,尿布垫BJ, Podtelejnikov AV Wisniewski JR .

通过液相色谱质谱筛查N-glycosylated蛋白质。

蛋白质组学,2004年2月,4 (2):454 - 65。

PubMed ID

14760718 (在PubMed

]

文摘

在过去的几年中质谱已成为首选的方法描述你的修改蛋白质。而大多数蛋白质化学修饰是二进制,只有一个改变可以关联到一个给定的残渣,许多不同的寡糖可以被附加到一个糖基化网站残渣。糖蛋白在复杂生物样品的详细描述是极具挑战性的。然而,N-glycosylation信息可以获得在一个中间水平。在这里我们展示一种程序映射N-glycosylation网站在复杂混合物通过减少样本复杂性和丰富糖蛋白的内容。糖基化的蛋白质是由最初的凝集素色谱步骤和消化endoproteinase Lys-C。糖化肽然后从消化混合物中选择第二凝集素色谱步骤。聚糖组件移除N-glycosidase F和肽与胰蛋白酶消化之前在线反相液相色谱质谱分析。使用两个不同的凝集素,伴刀豆球蛋白A和麦芽凝集素,这个过程应用于人血清和86 N-glycosylation网站在77年被确定的蛋白质。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
凝血酶原	P00734	细节
Corticosteroid-binding球蛋白	P08185	细节
抗凝血酶iii	P01008	细节
转体基因	P02766	细节
Serotransferrin	P02787	细节
Alpha-2-macroglobulin	P01023	细节
Alpha-1-acid糖蛋白1	P02763	细节
血清paraoxonase /芳香酯1	P27169	细节
Alpha-1-antitrypsin	P01009	细节
胰岛素样生长因子结合蛋白3	P17936	细节
Kininogen-1	P01042	细节
血管性血友病因子	P04275	细节
Vitronectin	P04004	细节
血浆铜蓝蛋白	P00450	细节
纤连蛋白	P02751	细节
纤维蛋白原γ链	P02679	细节
血浆丝氨酸蛋白酶抑制剂	P05154	细节
胆碱酯酶	P06276	细节
等离子体蛋白酶C1抑制剂	P05155	细节
Beta-2-glycoprotein 1	P02749	细节
Zinc-alpha-2-glycoprotein	P25311	细节
补体C3	P01024	细节
羧肽酶N亚基2	P22792	细节
Alpha-1-acid糖蛋白2	P19652	细节
Igα2链恒定区	P01877	细节
凝血因子十二世	P00748	细节
补充C4-A	P0C0L4	细节
补充C4-B	P0C0L5	细节
载脂蛋白D	P05090	细节
IgμC链	P01871	细节
Afamin	P43652	细节
Alpha-1B-glycoprotein	P04217	细节
Alpha-2-HS-glycoprotein	P02765	细节
C4b-binding蛋白α链	P04003	细节
补充成分C9	P02748	细节
补体因子H	P08603	细节
我补充因素	P05156	细节
Clusterin	P10909	细节
富亮氨酸alpha-2-glycoprotein	P02750	细节
Lumican	P51884	细节
C4b-binding蛋白β链	P20851	细节
Inter-alpha-trypsin抑制剂重链H1	P19827	细节
重链H4 Inter-alpha-trypsin抑制剂	Q14624	细节
Alpha-1-antichymotrypsin	P01011	细节
载脂蛋白b - 100	P04114	细节
血液结合素	P02790	细节
结合珠蛋白	P00738	细节