比较细胞色素3 a4抑制活动的最优化建模结构不同的化合物的使用逐步高钙,FA-MLR,请GFA G /请和安技术。

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罗伊·K Pratim罗伊·P

比较细胞色素3 a4抑制活动的最优化建模结构不同的化合物的使用逐步高钙,FA-MLR,请GFA G /请和安技术。

欧元J地中海化学。2009年7月,44(7):2913 - 22所示。doi: 10.1016 / j.ejmech.2008.12.004。Epub 2008年12月16日。

PubMed ID

19128860 (在PubMed

]

文摘

28结构不同的细胞色素3 a4 (CYP3A4)抑制剂受到(构象)定量结构活性关系的研究。分析与电子、空间、拓扑,和热力学描述符计算使用Cerius 2版本10软件。使用统计工具是线性的(多元线性回归和因子分析(FA-MLR)预处理步骤,逐步高,偏最小二乘(PLS),遗传函数算法(GFA),遗传请(G / PLS))和非线性方法(人工神经网络(ANN))。所有的5个线性建模方法显示n-octanol /水分配系数的重要性(logP)以及不同的拓扑和电子参数。最好的模型得到的训练集(逐步回归)基于外部预测R(2)最高价值和最低RMSEP价值也表现出良好的内部预测能力。FA-MLR等模型,请GFA和G /请也显著的内部和外部验证的特点。最好的模型(根据r (m)为测试集(2),所定义的最大功率罗伊,罗伊k,构象梳子。Sci。27(2008) 302 - 313]从安表现出好的r(2)价值(观测值和预测值之间的决定系数)的测试集化合物,这是优于其他除了逐步回归统计模型派生模型。然而,基于r (m)(2)价值(测试集),这惩罚模型观测值和预测值之间的巨大差异,看不到逐步MLR模型被发现除了请不如其他方法。考虑r (m)(2)值为整个设置,G /请派生模型似乎是这个数据集的最佳预测模型。从比较中选择最佳的预测模型模型,r (m)(2)基于分析的整套计算预测值的训练集和测试集化合物model-derived预测值是建议是一个很好的标准。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
溴麦角环肽	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	3.00 e + 03	N /一个	N /一个	细节
氯喹	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	3.50 e + 05	N /一个	N /一个	细节
西咪替丁	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	1.00 e + 06	N /一个	N /一个	细节
克霉唑	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	5.00 e + 01	N /一个	N /一个	细节
双氢麦角胺	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	3.00 e + 03	N /一个	N /一个	细节
地尔硫卓	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	2.17 e + 05	N /一个	N /一个	细节
益康唑	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	4.31 e + 02	N /一个	N /一个	细节
氟康唑	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	2.50 e + 04	N /一个	N /一个	细节
甲吡酮	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	4.93 e + 03	N /一个	N /一个	细节
咪康唑	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	8.51 e + 02	N /一个	N /一个	细节
硝苯地平	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	4.70 e + 04	N /一个	N /一个	细节
奥美拉唑	细胞色素P450 3 a4	集成电路50 (nM)	7.80 e + 04	N /一个	N /一个	细节