哺乳动物H+/肽共转运体PEPT1底物-内酰胺类抗生素与三肽的三维定量构效关系分析

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Biegel A, Gebauer S, Hartrodt B, Brandsch M, Neubert K, Thondorf I

哺乳动物H+/肽共转运体PEPT1底物-内酰胺类抗生素与三肽的三维定量构效关系分析

中华医学化学杂志2005 6月30日;48(13):4410-9。

PubMed ID

15974593 (PubMed视图

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摘要

利用膜转运蛋白PEPT1作为药物传递系统是提高口服药物生物利用度的一种有前途的策略。由于对PEPT1的底物结合位点知之甚少，因此计算方法是一个有意义的工具，可以更详细地了解底物的结构要求。采用比较分子相似指数分析(CoMSIA)方法对98种化合物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究。测定β -内酰胺类抗生素和三肽在Caco-2细胞上的亲和常数。得到了统计可靠的高预测能力模型(q(2) = 0.828, r(2) = 0.937)。从CoMSIA得到的结果使用不同的场贡献图进行了图形化解释。我们确定了那些对模拟肽和PEPT1相互作用至关重要的区域。新的3D-QSAR模型被用来设计一种新的模拟二肽的类药物化合物。实验验证了预测的K(i)值。

引用本文的药物库数据

药物靶点

药物	目标	种类	生物	药理作用	行动
苯氧甲基青霉素	溶质载体家族15个成员1	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
氨苄青霉素	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	15000000	N/A	N/A	细节
青霉素	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	> 30000000	N/A	N/A	细节
氯氨苄青霉素	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	> 10000000	N/A	N/A	细节
Cefadroxil	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	7200000	N/A	N/A	细节
头孢噻吩	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	> 10000000	N/A	N/A	细节
头孢吡肟	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	> 30000000	N/A	N/A	细节
头孢克肟	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	12000000	N/A	N/A	细节
头孢美唑	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	28000000	N/A	N/A	细节
头孢噻肟	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	> 30000000	N/A	N/A	细节
Cefradine	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	9800000	N/A	N/A	细节
Ceftibuten	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	340000	N/A	N/A	细节
头孢曲松钠	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	> 30000000	N/A	N/A	细节
头孢呋辛	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	26000000	N/A	N/A	细节
头孢氨苄	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	14000000	N/A	N/A	细节
邻氯青霉素	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	2500000	N/A	N/A	细节
Cyclacillin	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	500000	N/A	N/A	细节
双氯青霉素	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	7200000	N/A	N/A	细节
新青二	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	12000000	N/A	N/A	细节
苯氧甲基青霉素	溶质载体家族15个成员1	Ki (nM)	21000000	N/A	N/A	细节